Ιδρύθηκε με την αναδιάρθρωση του 2019[1] σαν «νέα ενδιάμεση κατηγορία» και διοργανώθηκε για πρώτη φορά την αγωνιστική περίοδο 2019–20 με συμμετοχή 12 ομάδων. Μέχρι τότε η δεύτερη κατηγορία του ελληνικού ποδοσφαίρου ήταν η Β΄ Εθνική (επονομαζόμενη Football League από το 2010). Παρά την ονομασία της και τον διακριτικό τίτλο, την διοργάνωση του πρωταθλήματος ανέλαβε η Ένωση Επαγγελματικού Ποδοσφαίρου Β΄ και Γ΄ Εθνικής Κατηγορίας, που διοργάνωνε το πρωτάθλημα της Football League (Ένωση Football League). Η διοργανώτρια μετονομάστηκε σε Ε.Ε.Π. Α2 και Β΄ Εθνικής, και το 2021 η Β΄ Εθνική που αποτελούσε πια την τρίτη κατηγορία, με νέα αναδιάρθρωση, συγχωνεύτηκε στην Α2 Εθνική και μετονομάστηκε εκ νέου σε Ε.Ε.Π. Α2 Εθνικής Κατηγορίας.[2]
Τις δυο πρώτες αγωνιστικές περιόδους μετά την ίδρυσή της, το πρωτάθλημα της Σούπερ Λιγκ 2 διεξήχθη με τη συμμετοχή 12 ομάδων σε έναν όμιλο, και τη διεξαγωγή αγώνων κατάταξης play-off και play-out για την τελική κατάταξη και τις θέσεις ανόδου και υποβιβασμού. Το πρώτο πρωτάθλημα της περιόδου 2019–20 συνέπεσε με την πανδημία της νόσου του κορονοϊού και διεκόπη πριν τη διεξαγωγή των σχετικών αγώνων κατάταξης.
Το 2021 με νέα αναδιάρθρωση η Φούτμπολ Λιγκ (3η κατηγορία) συγχωνεύτηκε στη Σούπερ Λιγκ 2, ενώ αποφασίστηκε και η συμμετοχή B' ομάδων τεσσάρων ΠΑΕ της κορυφαίας κατηγορίας. Έτσι, από την περίοδο 2021–22 το πρωτάθλημα θα διεξαχθεί σε 2 ομίλους με τη συμμετοχή 32 ομάδων με την προοπτική έως την περίοδο 2024–25 να μειωθούν σταδιακά σε 18 ομάδες σε έναν ενιαίο όμιλο.
* ανάμεσα στους πρωταθλητές και ορισμένους δευτεραθλητές των διοργανώσεων των περισσότερων τοπικών Ενώσεων Ποδοσφαιρικών Σωματείων (ΕΠΣ).
Οι τρεις μετονομασίες της κατηγορίας από την εισαγωγή της το 1962, δεν μετέβαλαν το επίπεδό της στην πυραμίδα του συστήματος των πρωταθλημάτων Ελλάδας.
Ελλάδα
2021–22