Η Αντιγόνεια βρίσκεται προς τα σύνορα της Ελλάδας με τα Σκόπια και νοτιοανατολικά της λίμνης Δοϊράνης. Είναι κτισμένη στους νότιους πρόποδες του όρους Δύσωρον (μέρος των Κρουσσίων Ορέων) σε υψόμετρο 370 μέτρων[2] απέχοντας 18 χλμ. Β. από το Κιλκίς, 12 χλμ από το τελωνείο Δοϊράνης και 74 χλμ. Β.-ΒΑ. από τη Θεσσαλονίκη. Στα μέσα του 15ου αιώνα, γύρω στο 1450 είχε 14 οικίες χριστιανών[3]. Σήμερα, θεωρείται προσφυγικό χωριό, αφού σε αυτό εγκαταστάθηκαν Πόντιοι πρόσφυγες (96 οικογένειες, 366 άτομα)[4] οι περισσότεροι από το Πεπερέκ ή Μπεμπερέκ (τουρ. Çetinsu/Τσετίνσου) της περιφέρειας Αρνταχάν της Τουρκίας[5] και αρκετες οικογενειες απο το Χαραμι Βαρταν της περιφερειας του Καρς
Το χωριό είχε παλιότερα το όνομα Μουράφτσα με το οποίο αναφέρεται επίσημα το 1919, στο ΦΕΚ 48Α-05/03/1919 να ορίζεται ως έδρα στην ομώνυμη κοινότητα. Μετονομάστηκε σε Αντιγόνεια το 1926[6]. Σύμφωνα με το πρόγραμμα Καλλικράτης, μαζί με τη Γάβρα, το Μονολίθι και το Μυλοχώρι αποτελούν την τοπική κοινότητα Αντιγονείας που ανήκει στη δημοτική ενότητα Κρουσσών του δήμου Κιλκίς και σύμφωνα με την απογραφή 2011 έχει πληθυσμό 109 κατοίκους.[7]. Η κοινότητα είναι χαρακτηρισμένη ως αγροτικός ημιορεινός οικισμός, με έκταση 28,273 χμ² (2011). [8]
