Το Εκκλησοχώρι βρίσκεται προς τα βορειοδυτικά όρια με την Περιφερειακή Ενότητα Θεσπρωτίας σε υψόμετρο 260 μέτρα.[3] Απέχει 33 χιλιόμετρα Δ.-ΒΔ. από την πόλη των Ιωαννίνων και 27 χλμ. Δ. από την Ελεούσα (έδρα του δήμου). Ανατολικά και νότια του χωριού περνάει ο Καλαμάς (Θύαμις) ενώ ανατολικά, δίπλα στον ποταμό, η ΕΟ Ιωαννίνων - Ηγουμενίτσας. Το χωριό αναφέρεται από την περίοδο της τουρκοκρατίας με την ονομασία Τσαρκοβίστα και στη οθωμανική στατιστική της Ηπείρου του 1895 καταγράφεται να απέχει: "4 ώρες από τα Γιάννενα, να έχει 55 χανέδες (φορολογούμενες οικογένειες/σπίτια), 165 άρρενες - 109 θήλεις".[4] Αποτελεί τον τόπο καταγωγής του θεολόγου καθηγητή Πανεπιστημίου του 19ου αιώνα Ευάγγελου Αντωνιάδη (1882-1962)[5] και του βραβευμένου φωτογράφου Άγγελου Καλογερίδη[6]. Ως οικισμός αναφέρεται επίσημα μετά την απελευθέρωση της Ηπείρου με την παλιά του ονομασία Τσαρκοβίστα Κουρέντων το 1919 στο ΦΕΚ 184Α - 19/08/1919 να ορίζεται έδρα της ομώνυμης νεοϊδρυθείσας κοινότητας. Το 1928 με το ΦΕΚ 81Α - 14/05/1928 μετονομάστηκε σε Εκκλησοχώριον.[7] Σύμφωνα με το σχέδιο Καλλικράτης αποτελεί την τοπική κοινότητα Εκκλησοχωρίου της δημοτικής ενότητας Μολοσσών που υπάγεται στο δήμο Ζίτσας και σύμφωνα με την απογραφή 2011 έχει πληθυσμό 33 κατοίκους.[8]