Η Παναγιά βρίσκεται στο οροπέδιο της λίμνης Ξυνιάδος 44 χιλιόμετρα από τη Λαμία και 15 χιλιόμετρα από τον Δομοκό. Διοικητικά υπάγεται στον Δήμο Δομοκού Είναι κτισμένη σε υψόμετρο 533 μέτρων στους πρόποδες του Ξεροβουνίου στις όχθες παλιάς λίμνης Ξυνιάδος. Γραπτές μαρτυρίες κάνουν λόγω για ύπαρξη του χωριού το 1805. Η αναφορά δωρητών στην Ιερά Μονή της Ρεντίνας στις μετά το 1640 στις μεταγενέστερες εγγραφές και στα φ.16α-17α από την «Παναγία του Δομοκού» οδηγούν στο συμπέρασμα να δημιουργήθηκε ο οικισμός μετά την ημερομηνία αυτή και πάντως πριν τον 19ο αιώνα.[1]
Στις 17 Μαΐου 1981 λειτούργησε το μεγαλύτερο εργοστάσιο βιομηχανικής Ντομάτας (ΑΒΕΚ ΝΟΜΙΚΟΣ) στο χωριό και έτσι δόθηκε η δυνατότητα σε όλους τους αγρότες της περιοχής να ασχοληθούν με τη νέα δυναμική καλλιέργεια.
Στην Παναγιά βρίσκεται και η θαυματουργή εικόνα της Παναγίας της Λιμνιώτισσας από την οποία πήρε το όνομα του το χωριό, και γιορτάζει στις 23 Αυγούστου.
Η κοινότητα Παναγίας συστάθηκε στις 30 Δεκεμβρίου 1965 με την απόσπαση του οικισμού Παναγία από την κοινότητα Ομβριακής και τον ορισμό του ως έδρα της κοινότητας. Λειτούργησε ως κοινότητα ως το 1998, οπότε προσαρτήθηκε στον δήμο Ξυνιάδας.[2]