Ο Άγιος Μάρκος βρίσκεται στα όρια του νομού με το νομό Σερρών. Είναι κτισμένος στις δυτικές πλαγιές του όρους Μαυροβούνι[1] (τμήμα των Κρουσσίων Ορέων) και νοτιοδυτικά της λίμνης Κερκίνης. Απέχει 28 χλμ. ΒΑ. από την πόλη του Κιλκίς και 79 χλμ. Β.-ΒΔ. από τη Θεσσαλονίκη. Στο χωριό αναβιώνεται το έθιμο των "Μωμόγερων" ή στα ποντιακά"Τα Μωμο’έρια" για τον ερχομό της νέας χρονιάς[2]. Μετά τους Βαλκανικούς πολέμους και την ανταλλαγή πληθυσμών, η Επιτροπή Αποκατάστασης Προσφύγων (ΕΑΠ) εγκατέστησε 60 οικογένειες προσφύγων από τον Πόντο[3]. Το χωριό παλιότερα ονομαζόταν Πεϊκοβο και έτσι αναφέρεται το 1919, μετά την απελευθέρωση, στο ΦΕΚ 48Α-05/03/1919 να προσαρτάται στην τότε κοινότητα Λελόβου. Μετονομάστηκε σε Άγιος Μάρκος το 1926[4]. Σύμφωνα με το πρόγραμμα Καλλικράτης, μαζί με την Άγιο Αντώνιο αποτελούν την τοπική κοινότητα Αγίου Μάρκου που ανήκει στη δημοτική ενότητα Κρουσσών του δήμου Κιλκίς και σύμφωνα με την απογραφή 2011 ως κοινότητα έχει πληθυσμό 169 κατοίκους ενώ ως οικισμός 68[5].
