Η Κοινότητα Αγίου Ιωάννου Αμαρίου είναι κοινότητα του Δήμου Αμαρίου στην Περιφερειακή Ενότητα Ρεθύμνης της Κρήτης η οποία συστάθηκε το 1925 με το ΦΕΚ 27Α - 31/01/1925 και έδρα τον οικισμό Άγιος Ιωάννης Αμαρίου.[1] Περιλαμβάνει μόνον την έδρα της και σύμφωνα με την απογραφή του 2011 έχει 117 κατοίκους[2] και εκπροσωπείται από τον πρόεδρο κ. Νικόλαο Βασιλάκη. Οι κάτωθι εκλέχθηκαν και υπηρέτησαν (ή υπηρετούν) ως πρόεδροί της: