Ριβοδιακόπτης

Στη μοριακή βιολογία, ριβοδιακόπτης είναι μία βραχεία αλληλουχία RNA, που αλλάζει διαμόρφωση όταν προσδένει μικρά μόρια, για παράδειγμα μεταβολίτες^[1]^[2]^[3]^[4]. Έτσι, ένα mRNA που περιέχει ριβοδιακόπτη εμπλέκεται άμεσα στη ρύθμιση της δικής του δραστηριότητας, σε απόκριση των συγκεντρώσεων του μορίου τελεστή του. Η ανακάλυψη ότι οι σύγχρονοι οργανισμοί χρησιμοποιούν το RNA για να δεσμεύσουν μικρά μόρια, επεκτείνει τις γνωστές φυσικές δυνατότητες του RNA πέρα από την ικανότητά του να κωδικοποιεί πρωτεΐνες, να καταλύει αντιδράσεις ή να δεσμεύει άλλα RNA ή πρωτεϊνικά μακρομόρια.

Ο αρχικός ορισμός του όρου ριβοδιακόπτης σχετίστηκε με τις συγκεντρώσεις μεταβολιτών^[5]. Οι περισσότερο γνωστοί ριβοδιακόπτες εμφανίζονται σε βακτήρια, αλλά λειτουργικοί ριβοδιακόπτες ενός τύπου (ριβοδιακόπτης TPP) έχουν ανακαλυφθεί σε φυτά και ορισμένους μύκητες. Ριβοδιακόπτες TPP έχουν προβλεφθεί επίσης για τα αρχαία^[6], αλλά δεν έχουν δοκιμαστεί πειραματικά.

Παραπομπές σημειώσεις

↑ «The riboswitch control of bacterial metabolism». Trends in Biochemical Sciences 29 (1): 11–17. January 2004. doi:10.1016/j.tibs.2003.11.004. PMID 14729327. https://archive.org/details/sim_trends-in-biochemical-sciences_2004-01_29_1/page/11.
↑ «Riboswitches as versatile gene control elements». Current Opinion in Structural Biology 15 (3): 342–348. June 2005. doi:10.1016/j.sbi.2005.05.003. PMID 15919195.
↑ «Riboswitches: the oldest mechanism for the regulation of gene expression?». Trends in Genetics 20 (1): 44–50. January 2004. doi:10.1016/j.tig.2003.11.008. PMID 14698618. https://archive.org/details/sim_trends-in-genetics_2004-01_20_1/page/44.
↑ «Structures of regulatory elements in mRNAs». Current Opinion in Structural Biology 16 (3): 299–306. June 2006. doi:10.1016/j.sbi.2006.05.001. PMID 16707260.
↑ «Genetic control by a metabolite binding mRNA». Chemistry & Biology 9 (9): 1043–1049. September 2002. doi:10.1016/S1074-5521(02)00224-7. PMID 12323379.
↑ «Metabolite-binding RNA domains are present in the genes of eukaryotes». RNA 9 (6): 644–647. June 2003. doi:10.1261/rna.5090103. PMID 12756322.

Περαιτέρω ανάγνωση

Ferré-D'Amaré, Adrian R.· Winkler, Wade C. (2011). «Chapter 5. The Roles of Metal Ions in Regulation by Riboswitches». Στο: Astrid Sigel, Helmut Sigel and Roland K. O. Sigel. Structural and catalytic roles of metal ions in RNA. Metal Ions in Life Sciences. 9. Cambridge, U.K.: RSC Publishing. σελίδες 141–173. doi:10.1039/9781849732512-00141. ISBN 978-1-84973-094-5. PMC 3454353 . PMID 22010271.

[pmid14729327-1] «The riboswitch control of bacterial metabolism». Trends in Biochemical Sciences 29 (1): 11–17. January 2004. doi:10.1016/j.tibs.2003.11.004. PMID 14729327. https://archive.org/details/sim_trends-in-biochemical-sciences_2004-01_29_1/page/11.

[pmid15919195-2] «Riboswitches as versatile gene control elements». Current Opinion in Structural Biology 15 (3): 342–348. June 2005. doi:10.1016/j.sbi.2005.05.003. PMID 15919195.

[pmid14698618-3] «Riboswitches: the oldest mechanism for the regulation of gene expression?». Trends in Genetics 20 (1): 44–50. January 2004. doi:10.1016/j.tig.2003.11.008. PMID 14698618. https://archive.org/details/sim_trends-in-genetics_2004-01_20_1/page/44.

[pmid16707260-4] «Structures of regulatory elements in mRNAs». Current Opinion in Structural Biology 16 (3): 299–306. June 2006. doi:10.1016/j.sbi.2006.05.001. PMID 16707260.

[pmid12323379-5] «Genetic control by a metabolite binding mRNA». Chemistry & Biology 9 (9): 1043–1049. September 2002. doi:10.1016/S1074-5521(02)00224-7. PMID 12323379.

[pmid12756322-6] «Metabolite-binding RNA domains are present in the genes of eukaryotes». RNA 9 (6): 644–647. June 2003. doi:10.1261/rna.5090103. PMID 12756322.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]