BioModels: Διαφορά μεταξύ των αναθεωρήσεων
μΧωρίς σύνοψη επεξεργασίας |
Χωρίς σύνοψη επεξεργασίας |
||
Γραμμή 1: | Γραμμή 1: | ||
{{Infobox biodatabase |
|||
| τίτλος = BioModels |
|||
| λογότυπος = |
|||
| περιγραφή = Αποθετήριο υπολογιστικών μοντέλων βιολογικού ενδιαφέροντος |
|||
| αντικείμενο = Υπολογιστικά μοντέλα |
|||
| οργανισμοί = Όλοι |
|||
| ερευνητικό_κέντρο = [[European Bioinformatics Institute|EMBL-EBI]], [[Babraham Institute|BI]], [[Caltech]] |
|||
| εργαστήριο = |
|||
| συγγραφείς = |
|||
| pmid = 20587024 |
|||
| ημερομηνία_έκδοσης = 2005 |
|||
| πρότυπα = |
|||
| μορφή = |
|||
| url = [http://www.ebi.ac.uk/biomodels/ EBI main instance], [http://biomodels.caltech.edu/ Caltech mirror] |
|||
| λήψη = |
|||
| υπηρεσία_ιστού = |
|||
| sql = |
|||
| sparql = |
|||
| διαδικτυακή_εφαρμογή = |
|||
| αυτόνομα_εργαλεία = |
|||
| άδεια = |
|||
| διαχείριση_εκδόσεων = |
|||
| συχνότητα = |
|||
| έκδοση = |
|||
| επιμέλεια = |
|||
| σελιδοδείκτες = |
|||
| συνδέσεις = |
|||
}} |
|||
Το BioModels είναι ένα δωρεάν αποθετήριο ανοιχτού κώδικα για την αποθήκευση, την ανταλλαγή και την ανάκτηση ποσοτικών μοντέλων βιολογικού ενδιαφέροντος που δημιουργήθηκε το 2006. Όλα τα μοντέλα στην επιμελημένη ενότητα της Βάσης Δεδομένων BioModels έχουν αξιοποιηθεί σε επιστημονικά αξιολογημένη βιβλιογραφία. |
Το BioModels είναι ένα δωρεάν αποθετήριο ανοιχτού κώδικα για την αποθήκευση, την ανταλλαγή και την ανάκτηση ποσοτικών μοντέλων βιολογικού ενδιαφέροντος που δημιουργήθηκε το 2006. Όλα τα μοντέλα στην επιμελημένη ενότητα της Βάσης Δεδομένων BioModels έχουν αξιοποιηθεί σε επιστημονικά αξιολογημένη βιβλιογραφία. |
||
Έκδοση από την 21:02, 4 Ιανουαρίου 2022
Περιεχόμενο | |
---|---|
Περιγραφή | Αποθετήριο υπολογιστικών μοντέλων βιολογικού ενδιαφέροντος |
Αντικείμενο | Υπολογιστικά μοντέλα |
Οργανισμοί | Όλοι |
Επαφή | |
Ερευνητικό κέντρο | EMBL-EBI, BI, Caltech |
Πρώτη αναφορά | 20587024 |
Ημερομηνία έκδοσης | 2005 |
Πρόσβαση | |
Ιστοσελίδα | EBI main instance, Caltech mirror |
Εργαλεία | |
Διάφορα |
Το BioModels είναι ένα δωρεάν αποθετήριο ανοιχτού κώδικα για την αποθήκευση, την ανταλλαγή και την ανάκτηση ποσοτικών μοντέλων βιολογικού ενδιαφέροντος που δημιουργήθηκε το 2006. Όλα τα μοντέλα στην επιμελημένη ενότητα της Βάσης Δεδομένων BioModels έχουν αξιοποιηθεί σε επιστημονικά αξιολογημένη βιβλιογραφία.
Τα μοντέλα που είναι αποθηκευμένα στο οργανωμένο τμήμα της BioModels είναι συμβατά με το MIRIAM, το πρότυπο επιμέλειας και σχολιασμού μοντέλων. Τα μοντέλα έχουν προσομοιωθεί από επιμελητές ώστε να ελέγχεται ότι όταν εκτελούνται σε προσομοιώσεις, παρέχουν τα ίδια αποτελέσματα με αυτά που περιγράφονται στη δημοσίευση. Τα στοιχεία του μοντέλου σημειώνονται, ώστε οι χρήστες να μπορούν εύκολα να αναγνωρίζουν κάθε στοιχείο του μοντέλου και να ανακτούν περαιτέρω πληροφορίες από άλλες πηγές.
Οι μοντελιστές μπορούν να υποβάλουν τα μοντέλα σε μορφή SBML και CellML. Τα μοντέλα μπορούν, στη συνέχεια, να ληφθούν σε μορφή SBML, VCML, XPP, SciLab, Octave, BioPAX και RDF/XML. Τα δίκτυα αντίδρασης των μοντέλων παρουσιάζονται σε ορισμένες μορφές γραφικών, όπως PNG, SVG και γραφική μικροεφαρμογή Java, στην οποία ορισμένα δίκτυα παρουσιάστηκαν ακολουθώντας τη Γραφική Σημειογραφία της Βιολογίας Συστημάτων. Επίσης, μία αναγνώσιμη περίληψη κάθε μοντέλου είναι διαθέσιμη σε μορφή PDF.[1]
Εξωτερικοί Σύνδεσμοι
https://www.ebi.ac.uk/biomodels/
Παραπομπές
- ↑ «BioModels» (στα αγγλικά). Wikipedia. 2021-10-08. https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=BioModels&oldid=1048901299.