Από το 1490 έως το 1523 και πάλι από το 1544 έως το 1773, το Δουκάτο χωρίστηκε μεταξύ διαφόρων κλάδων του Όλντενμπουργκ, ιδίως των δούκων του Χόλσταϊν-Γκλούκστατ (πανομοιότυπος με τους Βασιλείς της Δανίας) και των Χόλσταϊν-Γκόττορπ. Το Δουκάτο έπαψε να υπάρχει όταν το Βασίλειο της Πρωσίας το προσαρτήθηκε το 1866 μετά τον Αυστρο-Πρωσικό πόλεμο.