Το πρωτάθλημα της Ένωσης Πειραιώς της περιόδου 1987-88 διοργανώθηκε σε τρεις κατηγορίες. Συνολικά, στα πειραϊκά πρωταθλήματα πήραν μέρος 99 σύλλογοι. Τους τίτλους των δυο ομίλων της Α΄ Κατηγορίας κατέκτησαν ο Μανδραϊκός και ο Α.Ο. Ζέας. Υπερπρωταθλήτρια Πειραιώς ανακηρύχθηκε η ομάδα του Μανδραϊκού, επικρατώντας της αντιπάλου του με σκορ 3-1. Και οι δυο πρωταθλήτριες ανέβηκαν στη Δ΄Εθνική της περιόδου 1988-89.
Στο θεσμό του κυπέλλου συμμετέχουν τα σωματεία της Ε.Π.Σ. Πειραιά. Στον τελικό της διοργάνωσης της περιόδου 1987-88 αγωνίστηκαν οι Ατρόμητος Πειραιώς και Α.Π.Σ. Αμφιάλη και κυπελλούχος αναδείχθηκε ο Ατρόμητος για πρώτη φορά στην ιστορία του.[9]