Το πρωτάθλημα Ελλάδας πόλο της περιόδου 1986–1987, ήταν το πρώτο πρωτάθλημα της νεοσύστατης Α1 Εθνικής, η οποία προέκυψε από τη διάσπαση της Α΄ Εθνικής σε Α1 και Α2. Συμμετείχαν οκτώ ομάδες που αγωνίστηκαν σε δύο φάσεις, την κανονική περίοδο και τα πλέι οφ. Η κανονική περίοδος ξεκίνησε στις 17 Ιανουαρίου του 1987, και ολοκληρώθηκε στις 3 Ιουνίου. Τα πλέι οφ ξεκίνησαν στις 6 Ιουνίου και ολοκληρώθηκαν στις 7 Ιουλίου. Πρωταθλήτρια αναδείχθηκε η ομάδα της Γλυφάδας για δεύτερη συνεχόμενη χρονιά.
Στα πλέι οφ προκρίθηκαν οκτώ ομάδες, οι έξι πρώτες της Α1 και οι δύο πρώτες της Α2 (Ηρακλής Θεσσαλονίκης και ΝΑΟ Κέρκυρας). Στα προημιτελικά διασταυρώθηκαν ως εξής: 1ος-6ος, 2ος-5ος, 3ος-2ος Α2, 4ος-1ος Α2. Δεν μεταφέρθηκαν τα αποτελέσματα της κανονικής περιόδου. Οι σειρές κρίθηκαν με βάση τους βαθμούς (2 η νίκη, 1 η ισοπαλία και 0 η ήττα), την πρόκριση κέρδιζε η ομάδα που έφτανε ή ξεπερνούσε πρώτη το όριο των τριών βαθμών.
Στους παρθενικούς τελικούς της Α1, η Γλυφάδα αντιμετώπισε τον Εθνικό. Η Γλυφάδα πήρε μια μεγάλη νίκη στον πρώτο αγώνα μέσα στον Πειραιά, και χάρη στην ισοπαλία στον δεύτερο αγώνα στην έδρα της, έφτασε πρώτη το όριο των τριών βαθμών και αναδείχθηκε πρωταθλήτρια στο πρώτο πρωτάθλημα της Α1 Εθνικής κατηγορίας.